細菌可以分為六大類：

　　1. 革蘭氏陽性菌（Gram-positive bacteria）：細胞壁含有大量的肽聚糖，可以染上靛紫，如鏈球菌、葡萄球菌等。

　　2. 革蘭氏陰性菌（Gram-negative bacteria）：細胞壁較薄，不能染上靛紫，但可以染上伊紅染，如大腸桿菌、沙門氏菌等。

　　3. 原核生物（Prokaryotes）：沒有真核細胞器，如細菌、古細菌等。

　　4. 真核生物（Eukaryotes）：有真核細胞器，如真菌、動物、植物等。

　　5. 好氧菌（Aerobic bacteria）：需要氧氣生長的細菌，如鏈球菌、葡萄球菌等。

　　6. 嗜熱菌（Thermophilic bacteria）：可以在高溫環境下生長的細菌，如熱泉中的嗜熱菌。