生豆芽根長頸短的原因是因為生長過程中，種子脫殼后，先是出現了根尖的向下生長，然后是生長出頸部，最后才是出現了嫩芽。如果種子在發芽初期生長環境不穩定，如水分不足、溫度過高或過低等因素，就會導致生長不正常，使得根長而頸短。如果生長的環境中光照較強或風力過大等也可能導致生長不正常，使得豆芽的根長而頸短。在種植豆芽時要注意提供適宜的生長環境，保證其正常生長。